Задание 30221 ЕГЭ по русскому языку

Укажите цифру(-ы), на месте которой(-ых) должна(-ы) стоять запятая(-ые).

Что задержавшийся там делал это небольшое время (1) оставалось загадкой (2) но их командир знал (3) что (4) и (5) когда догнавший поравнялся с ним (6) впереди послышались их короткие и малопонятные реплики.